我国是世界柑桔重要起源中心。改革开放以来，柑桔产业迅猛发展，已经成为我国南方主产区农村经济的一大支柱产业，目前我国柑桔面积居世界第一位，产量居第三位，但在区域布局、品种结构、良种繁育和产业化经营等方面与柑桔生产发达国家相比，还有很大差距。
为解决我国柑桔产业化发展与迎接加入WTO挑战中面临的一系列科技问题，“十五”期间我所主要科研发展方向仍以应用研究为主，与产业紧密结合，加大科技成果的推广力度，加强对资源优势的开发利用，同时适当注重基础性研究，争取在多个领域中处于国内领先水平，扩大在国内外同行中的影响；配合学校教学，加强研究生培养，推行产、学、研一体化。
种质资源收集、评价与利用研究
本研究方向以赵晓春研究员为学术带头人，周志钦教授、江东副研究员、朱世平副研究员、闫树堂副研究员等为骨干成员，依托国家果树种质重庆柑桔圃等平台，主要开展柑桔种质资源的收集、保存、鉴定和评价研究，系统开展柑桔起源、分类和分子进化，以及种质创新和重要基因的鉴定、发掘及利用研究。
产业信息与经济研究
本研究方向以吴涛副编审、饶述军副编审、李治飞副编审、张放副主编、肖田副编审、王树良副研究员、黄森副研究员等为骨干成员。主要开展产业信息研究和服务，编辑出版《中国南方果树》和《中国果业信息》杂志，主办“中柑所在线”（http://www.cric.cn）和“中国果业信息网（http://gyxx.cric.cn）”等信息服务网站
遗传育种
本研究方向以陈善春研究员为学术带头人，何永睿副研究员、洪棋斌副研究员、邹修平副研究员、龚桂枝副研究员、姚利晓副研究员、李强博士、雷天刚博士、彭爱红博士、龙琴博士、许兰珍博士、彭祝春助理研究员等为骨干成员。依托国家柑桔品种改良中心、国家柑橘工程技术研究中心等平台。
病虫害防控
本研究方向以周常勇研究员和李中安研究员为学术带头人，冉春、王雪峰、周彦、宋震、青玲等为骨干成员，依托国家柑桔苗木脱毒中心等平台开展科研创新和服务。
栽培生理与智慧化
本研究领域以彭良志研究员为学术带头人，邓烈研究员、何绍兰副研究员、雷霆副研究员、凌丽俐副研究员、郑永强副研究员、淳长品副研究员、易时来副研究员、曹立副研究员、江才伦高级农艺师、付行政博士、谢让金博士、吕强博士为骨干成员。
贮藏加工研究
本研究方向以王华研究员、窦华亭研究员为学术带头人，孙志高副研究员、王日葵副研究员、马亚琴副研究员、周炼高级实验师，以及贺明阳博士、韩冷博士、黄林华博士和谭祥博士等为骨干成员，依托国家柑桔工程技术研究中心、国家柑桔加工技术研发分中心、柑桔学重庆市重点实验室等平台。 “111”创新引智基地，入选教育部及农业农村部创新团队。
质量安全与标准研究
本研究方向以焦必宁研究员为学术带头人，王成秋副研究员、何悦教授、张耀海副研究员、崔永亮副研究员、李晶副教授、赵其阳高级实验师等为骨干成员。依托农业农村部柑桔及苗木质量监督检验测试中心、农业农村部柑桔产品质量安全风险评估实验室(重庆)、西南大学农药残留检测与安全评价实验室等平台，主要开展果蔬质量安全检测技术研发；柑桔产品溯源技术研究；柑桔质量安全风险监测评估研究；柑桔产品营养功能评价；柑桔质量安全标准研制及农作物上农药残留登记试验项目。
柑桔所成立于1960年，位于重庆市北碚区国家级风景名胜区缙云山麓，风景秀丽的嘉陵江畔，毗邻大磨滩湿地公园，占地面积1918亩，是唯一的国家级柑桔专业科研机构，正在打造国家柑桔公园。点击查看【建所60周年工作回顾视频】
所徽“天圆地方”，反映中柑所人“壹志嘉树”，以推进柑桔科技进步、产业发展为立所根本之严谨风格和博大胸怀；核心的圆形简洁勾画出“柑桔”、形象反映出中柑所专注柑桔科研的行业特征；而围绕主体的弧线代表了科技，象征着中柑所人“修远求索”的治学态度，求真务实的科研精神；星形元素立意中柑所人志在建立一个“方圆”宇宙之间柑桔科研领域的一颗的明星，闪闪发光，惠泽全人类。
“壹志嘉树，修远求索”，分别选自中国历史上第一位伟大的爱国诗人屈原《橘颂》和《离骚》中的名句。这八个字是五十年来柑桔所人传承积淀下来的优良传统、精神风貌及办所理念的高度浓缩和凝炼提升，并与中国数千年博大精深的文化底蕴和人文精神相互交融辉映，寓意深远 ...
