改良中心团队研制出首款柑橘液相育种芯片：橘芯1号

近日，“中心”改良中心团队研制的首款柑橘液相育种芯片获得国家发明专利授权（专利号：ZL202310298166.5）。

育种芯片是生物育种体系中种质资源基因型检测的重要工具，在农作物遗传改良与育种研究中发挥重要作用。然而，目前尚无成熟的柑橘基因分型芯片。为提高柑橘育种效率、加快柑橘育种进程，开发一款经济、高效的基因分型芯片十分必要。

陈善春研究员、何永睿研究员和李强副教授等以国家柑橘种质资源圃300多个代表性柑橘品种为材料（包括宽皮柑橘、橙、柚和柠檬等多类重要材料），通过深度重测序筛选出4万余个核心SNP位点。同时，加入了数千个与柑橘重要性状紧密关联的SNP位点，利用博瑞迪生物的靶向捕获技术开发了柑橘全基因组40K液相育种芯片-橘芯1号。该芯片为世界首款柑橘液相芯片，填补了国内空白。橘芯1号液相育种芯片的位点检出率大于96%，能够针对同一个SNP位点进行多次检测，变异位点鉴定的准确性相比传统的固相芯片更高；液相芯片的基因分型成本仅为传统固相芯片的十分之一，能够低成本、高通量地进行柑橘基因分型，进一步为资源鉴定、全基因组关联、遗传分析等提供基因组学资源。橘芯1号液相芯片的使用将为开展柑橘生物育种、开发柑橘全基因组选择育种平台打下基础，有助于提高育种效率，设计培育高产、优质的柑橘新品种，具有巨大的应用前景。

西南大学是该成果的专利权人，李强、喻奇缘、陈善春、何永睿、张晨希、线宝航、贾瑞瑞、龙琴、傅佳和雷天刚是该成果的发明人，团队正在通过PCT途径申请美国专利（申请号：PCT/CN2023/088049）。

该成果得到了国家重点研发计划项目（2022YFD1201600）、现代农业（柑桔）产业技术体系（CARS-26）和西部（重庆）科学城种质创制大科学中心项目等资助。